到6月1日傍晚，搜救人员又打捞出一具遇难者遗体，寻获遇难者遗体数已达102具，确定身份并由家属领回的遗体已有98具。同时搜救人员通过声纳系统在澎湖海域发现一个金属物体，经研究可能是飞机机头的残骸，判断里面可能还有遇难者遗体。台湾“华航”黑匣子的打捞工作仍在进行之中，由于风浪较大，给打捞工作造成一定的影响。