在事故原因的调查方面，尽管各方对于飞机在1万米空中解体坠海这一解释已经有了共识，但空难的真正原因仍有待调查，在黑匣子被找到和破译之前，所有的原因解释只能是猜测。我们来听听专家的说法。

专家介绍说，从目前已经了解到的情况看来，造成飞机空中解体至少有4种可能性。第一种是机械故障，目前华航方面已经否认了这种可能，第二种是飞机爆炸，但由于已经打捞上来的遗体都很完整，没有遭到严重外伤，或烧伤的痕迹，所以，这种可能性也不大。第三是因为机龄老旧，金属疲劳而造成飞机突然分崩瓦解，华航也否认了这种可能。第四是飞机承受外力造成解体。所谓的外力包括飞弹，或者有人携带爆裂物或将爆裂物托运行李上飞机等。另外，今天台湾有关方面已经初步排除了恐怖分子袭击，或者是遭到炮击的可能性。由于现在确定飞机是在高空解体，所以目前台湾方面除了调查失事班机的机械原因外，也在对是否有外力介入展开地毯式清查。桃园县调查站人员对旅客候机室、行李托运处等地点进行全面查访，并调阅了25号当天机场监视录象画面，全面清查当天乘客的资料情况。