水稻基因组“工作框架图”发表的消息在国际科学界引起了强烈反响，科学家们认为中国已进入世界生物学研究的前沿。

除了《科学》杂志的社论和该杂志的主编对此给予高度评价之外，《科学》杂志的论文评审人说，这一里程碑性的论文说明中国已经进入生物学研究的前沿，证明中国科学家已在同一水平上并具有国际性的竞争能力。国际人类基因组计划主要负责人柯林斯教授闻讯后，对我国科学家表示了热情洋溢的祝贺，他说，这是基因组研究的重大里程碑，这不仅是由于水稻在农业上的重要性，而且是由于水稻能提供其他植物的重要生物学基本知识。这位人类基因组计划掌门人还说，你们开发的识别重复序列并进行全基因组组装的软件更值得祝贺。美国麻省理工学院怀特·黑德研究所基因组研究中心主任兰德博士则说，这一论文是一个里程碑的成果，水稻作为农作物的重要性与水稻基因组序列对生物学与农业的重要性怎么评估都不过分，你们为公众提供的序列将受到科学界的尊敬与感谢。